Gestión de aplicaciones
Los usuarios de supercomputación disponen de una serie de aplicaciones científicas de diversas áreas ya instaladas y listas para usar. Los detalles acerca del uso las mismas pueden encontrarse a través de los enlaces para cada aplicación, en la página de aplicaciones.
Asimismo, para aquellos usuarios que deseen construir y/u optimizar aplicaciones por sí mismos, se proporciona un conjunto de herramientas y bibliotecas de desarrollo (compiladores, bibliotecas matemáticas, bibliotecas de paso de mensajes, etc.). Las instrucciones de uso de las mismas pueden encontrarse en sus respectivas páginas (desarrollo, bibliotecas de desarrollo).
Módulos disponibles
Para ver que módulos se encuentran disponibles puede usar el siguiente comando:
Herramientas de desarrollo
Estas son algunas de las herramientas con las que el usuario puede compilar, trazar y linkar sus aplicaciones. Los compiladores de Intel están optimizados para la arquitectura de las distintas plataformas que ofrecemos.
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Listado de aplicaciones
Las siguientes aplicaciones han sido instaladas y son mantenidas por el personal del Servicio de Supercomputación. Todas ellas constan de su correspondiente licencia de uso a nombre del Servicio de Supercomputación. Cualquier usuario que utilice estas aplicaciones se compromete a seguir las reglas de uso que aparecen en estas licencias.
En caso de que necesite otra aplicación no incluida en el listado inferior, puede sugerirnos su instalación, y estudiaremos si es viable.
Si usted desarrolla sus aplicaciones o pretende ejecutar diferentes aplicaciones de las abajo indicadas consulte cómo lanzar trabajos usando el sistema de colas.
| Software | Arquitectura |
|---|---|
| adios/1.13.1 | Albaicín |
| arpack-ng/3.7.0-foss-2020a | Albaicín |
| Autoconf/2.69-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Automake/1.16.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| autotools | Albaicín |
| Autotools/20180311-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| BamTools/2.5.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| bcbio-gff/0.6.6-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| BCFtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| BEDTools/2.29.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| binutils/2.34 | Albaicín |
| binutils/2.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| biom-format/2.1.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| BioPerl/1.7.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Biopython/1.78-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| Bison/3.5.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Bison/3.8.2 | Albaicín |
| BLAST+/2.10.1-gompi-2020a | Albaicín |
| BLIS/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
| Boost.Python/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
| Boost/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
| boost/1.75.0 | Albaicín |
| Bowtie2/2.4.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| bzip2/1.0.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cairo/1.16.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| CD-HIT/4.8.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| charliecloud/0.15 | Albaicín |
| CLISP/2.49-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| CMake/3.16.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cmake/3.19.4 | Albaicín |
| CMSeq/1.0.3-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| CP2K/7.1-foss-2020a | Albaicín |
| cURL/7.69.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cutadapt/2.10-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| DB_File/1.835-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DB/18.1.32-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DBus/1.13.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DendroPy/4.4.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DFTD4/dftd4-3.5 | Albaicín |
| DIAMOND/2.0.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| dimemas/5.4.2 | Albaicín |
| double-conversion/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Doxygen/1.8.17-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| EasyBuild/4.6.2 | Albaicín |
| Eigen/3.3.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Eigen/3.4.0 | Albaicín |
| ELPA/2020.11.001-foss-2020a | Albaicín |
| expat/2.2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| extrae/3.7.0 | Albaicín |
| FastTree/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| fftw/3.3.8 | Albaicín |
| FFTW/3.3.8-GCC-9.3.0-serial | Albaicín |
| FFTW/3.3.8-gompi-2020a | Albaicín |
| flex/2.6.4 | Albaicín |
| flex/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FLTK/1.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| fontconfig/2.13.92-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| foss/2020a | Albaicín |
| freeglut/3.2.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FreeSurfer/7.3.2 | Albaicín |
| freetype/2.10.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FriBidi/1.0.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FSL/6.0.5.2 | Albaicín |
| g09 | Albaicín |
| gc/7.6.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GCC/9.3.0 | Albaicín |
| GCCcore/9.3.0 | Albaicín |
| gettext/0.20.1 | Albaicín |
| gettext/0.20.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Ghostscript/9.52-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| git/2.23.0-GCCcore-9.3.0-nodocs | Albaicín |
| GL2PS/1.4.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLib/2.64.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLM/0.9.9.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLPK/4.65-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GMP/6.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| gnu9/9.3.0 | Albaicín |
| gnuplot/5.2.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GObject-Introspection/1.64.0-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| gompi/2020a | Albaicín |
| gperf/3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GraphicsMagick/1.3.36-foss-2020a | Albaicín |
| groff/1.22.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GROMACS/gromacs-2023 | Albaicín |
| gsl/2.6 | Albaicín |
| GSL/2.6-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| Guile/1.8.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| gzip/1.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| h5py/2.10.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| HarfBuzz/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| hdf5/1.10.6 | Albaicín |
| HDF5/1.10.6-gompi-2020a | Albaicín |
| HDF5/1.12.0-gompi-2020a | Albaicín |
| help2man/1.47.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| HTSlib/1.10.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| HTSlib/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| humann/humann-3.6.1 | Albaicín |
| hwloc/2.1.0 | Albaicín |
| hwloc/2.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| hypre/2.18.1 | Albaicín |
| ICU/66.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ImageMagick/7.0.10-1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| imb/2019.6 | Albaicín |
| intltool/0.51.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| IQ-TREE/2.1.2-foss-2020a | Albaicín |
| JasPer/2.0.14-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Java/11.0.2 | Albaicín |
| Julia/1.8.2-linux-x86_64 | Albaicín |
| kallisto/0.46.2-foss-2020a | Albaicín |
| Kraken/1.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libcerf/1.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libdrm/2.4.100-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libevent/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libfabric/1.11.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libfabric/1.11.2 | Albaicín |
| libffcall/2.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libffi/3.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libFLAME/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
| libgd/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libGLU/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libglvnd/1.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libiconv/1.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libidn2/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Libint/2.6.0-gompi-2020a-lmax-6-cp2k | Albaicín |
| libjpeg-turbo/2.0.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libmatheval/1.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libpciaccess/0.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libpng/1.6.37-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libreadline/8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsigsegv/2.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsndfile/1.0.28-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsodium/1.0.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LibTIFF/4.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libtool/2.4.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libunistring/0.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libunwind/1.3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libxc/4.3.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| libxml2/2.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libxsmm/1.16.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| likwid/5.0.1 | Albaicín |
| LittleCMS/2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LLVM/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LMDB/0.9.24-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LSD2/1.9.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Lua/5.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| lz4/1.9.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| M4/1.4.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| M4/1.4.19 | Albaicín |
| MAFFT/7.453-GCC-9.3.0-with-extensions | Albaicín |
| MAFFT/7.453-gompi-2020a-with-extensions | Albaicín |
| MAGMA/1.09b-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| make/4.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| makeinfo/6.7-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
| Mako/1.1.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| MATIO/1.5.19-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| matplotlib/3.2.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| maxima | Albaicín |
| MCL/14.137-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Mesa/20.0.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Meson/0.55.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| MetaPhlAn/3.0.9-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| metis/5.1.0 | Albaicín |
| METIS/5.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| mfem/4.2 | Albaicín |
| Miniconda3/4.9.2 | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ofi | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
| mumps/5.2.1 | Albaicín |
| MUSCLE/3.8.31-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
| mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
| NASM/2.14.02-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ncurses/6.1 | Albaicín |
| ncurses/6.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| netcdf-cxx/4.3.1 | Albaicín |
| netcdf-fortran/4.5.2 | Albaicín |
| netCDF-Fortran/4.5.2-gompi-2020a | Albaicín |
| netcdf/4.7.3 | Albaicín |
| netCDF/4.7.4-gompi-2020a | Albaicín |
| NetLogo/6.2.0-64 | Albaicín |
| nettle/3.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Ninja/1.10.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NLopt/2.6.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NSPR/4.25-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NSS/3.51-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| numactl/2.0.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| nwchem-7.0.2 | Albaicín |
| Octave/6.2.0-foss-2020a | Albaicín |
| ohpc | Albaicín |
| omb/5.6.2 | Albaicín |
| omb/5.6.2 | Albaicín |
| openblas/0.3.7 | Albaicín |
| OpenBLAS/0.3.9-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
| opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
| OpenMPI/4.0.3-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| openmpi4/4.0.5 | Albaicín |
| OpenPGM/5.2.122-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| orca | Albaicín |
| os | Albaicín |
| Pango/1.44.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| papi/5.7.0 | Albaicín |
| parallel/20200522-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ParMETIS/4.0.3-gompi-2020a | Albaicín |
| PCRE/8.44-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| PCRE2/10.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pdtoolkit/3.25.1 | Albaicín |
| Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
| petsc/3.14.4 | Albaicín |
| petsc/3.14.4 | Albaicín |
| phdf5/1.10.6 | Albaicín |
| phdf5/1.10.6 | Albaicín |
| PhyloPhlAn/3.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| pixman/0.38.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pkg-config/0.29.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pkgconfig/1.5.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| plasma/2.8.0 | Albaicín |
| PLUMED/2.6.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| PMIx/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pnetcdf/1.12.1 | Albaicín |
| PnetCDF/1.12.1-gompi-2020a | Albaicín |
| poetry/1.0.9-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| PRANK/170427-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| protobuf/3.13.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| prun/2.1 | Albaicín |
| ptscotch/6.0.6 | Albaicín |
| py3-mpi4py/3.0.3 | Albaicín |
| py3-numpy/1.19.0 | Albaicín |
| py3-scipy/1.5.1 | Albaicín |
| pybind11/2.4.3-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| Pysam/0.16.0.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| Python/2.7.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Python/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| QIIME2/2021.8 | Albaicín |
| qrupdate/1.1.2-foss-2020a | Albaicín |
| R/3.6.3 | Albaicín |
| R/4.0.0-foss-2020a | Albaicín |
| re2c/1.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Roary/3.13.0-foss-2020a | Albaicín |
| SAMtools/1.10-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| SAMtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| scalapack/2.1.0 | Albaicín |
| ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2020a | Albaicín |
| ScaLAPACK/2.2-gompi-2020a-amd | Albaicín |
| scalasca/2.5 | Albaicín |
| SciPy-bundle/2020.03-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| scorep/6.0 | Albaicín |
| scotch/6.0.6 | Albaicín |
| SCOTCH/6.0.9-gompi-2020a | Albaicín |
| Seaborn/0.10.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| SEPP/4.3.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| siesta | Albaicín |
| Singular/4.3.0 | Albaicín |
| singularity/3.7.1 | Albaicín |
| sionlib/1.7.4 | Albaicín |
| sklearn-som/1.1.0-foss-2020a | Albaicín |
| slepc/3.14.2 | Albaicín |
| snappy/1.1.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| SQLite/3.31.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| STAR/2.7.7a-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| strainviz/StrainViz-1.1 | Albaicín |
| SuiteSparse/5.7.1-foss-2020a-METIS-5.1.0 | Albaicín |
| superlu_dist/6.1.1 | Albaicín |
| superlu/5.2.1 | Albaicín |
| SWIG/4.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Szip/2.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| tabixpp/1.1.0-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| tau/2.29 | Albaicín |
| tbb/2020.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tcl/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| texinfo/6.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tk/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tkinter/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Trilinos/12.12.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| trilinos/13.0.0 | Albaicín |
| trimAl/1.4.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| UCX/1.8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ucx/1.9.0 | Albaicín |
| UDUNITS/2.2.26-foss-2020a | Albaicín |
| UnZip/6.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| USEARCH/11.0.667-i86linux32 | Albaicín |
| util-linux/2.35-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| valgrind/3.16.1 | Albaicín |
| wget/1.20.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| X11/20200222-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| XML-LibXML/2.0205-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| xorg-macros/1.19.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| xprop/1.2.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| XZ/5.2.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| yaml-cpp/0.6.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ZeroMQ/4.3.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| zlib/1.2.11 | Albaicín |
| zlib/1.2.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| zstd/1.4.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |