Gestión de aplicaciones
Los usuarios de supercomputación disponen de una serie de aplicaciones científicas de diversas áreas ya instaladas y listas para usar. Asimismo, para aquellos usuarios que deseen construir y/u optimizar aplicaciones por sí mismos, se proporciona un conjunto de herramientas y bibliotecas de desarrollo (compiladores, bibliotecas matemáticas, bibliotecas de paso de mensajes, etc.).
Módulos disponibles
Para ver que módulos se encuentran disponibles puede usar el siguiente comando:
Herramientas de desarrollo
Estas son algunas de las herramientas con las que el usuario puede compilar, trazar y linkar sus aplicaciones. Los compiladores de Intel están optimizados para la arquitectura de las distintas plataformas que ofrecemos.
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Listado de aplicaciones
Las siguientes aplicaciones han sido instaladas y son mantenidas por el personal del Servicio de Supercomputación. Todas ellas constan de su correspondiente licencia de uso a nombre del Servicio de Supercomputación. Cualquier usuario que utilice estas aplicaciones se compromete a seguir las reglas de uso que aparecen en estas licencias.
Nota
En caso de que necesite otra aplicación no incluida en el listado inferior, puede sugerirnos su instalación, y estudiaremos si es viable.
Si usted desarrolla sus aplicaciones o pretende ejecutar diferentes aplicaciones de las abajo indicadas consulte cómo lanzar trabajos usando el sistema de colas.
| Software | Arquitectura |
|---|---|
| adios/1.13.1 | Albaicín |
| arpack-ng/3.7.0-foss-2020a | Albaicín |
| Autoconf/2.69-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Automake/1.16.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| autotools | Albaicín |
| Autotools/20180311-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| BamTools/2.5.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| bcbio-gff/0.6.6-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| BCFtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| BEDTools/2.29.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| binutils/2.34 | Albaicín |
| binutils/2.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| biom-format/2.1.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| BioPerl/1.7.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Biopython/1.78-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| Bison/3.5.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Bison/3.8.2 | Albaicín |
| BLAST+/2.10.1-gompi-2020a | Albaicín |
| BLIS/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
| Boost.Python/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
| Boost/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
| boost/1.75.0 | Albaicín |
| Bowtie2/2.4.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| bzip2/1.0.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cairo/1.16.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| CD-HIT/4.8.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| charliecloud/0.15 | Albaicín |
| CLISP/2.49-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| CMake/3.16.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cmake/3.19.4 | Albaicín |
| CMSeq/1.0.3-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| CP2K/7.1-foss-2020a | Albaicín |
| cURL/7.69.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| cutadapt/2.10-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| DB_File/1.835-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DB/18.1.32-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DBus/1.13.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DendroPy/4.4.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| DFTD4/dftd4-3.5 | Albaicín |
| DIAMOND/2.0.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| dimemas/5.4.2 | Albaicín |
| double-conversion/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Doxygen/1.8.17-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| EasyBuild/4.6.2 | Albaicín |
| Eigen/3.3.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Eigen/3.4.0 | Albaicín |
| ELPA/2020.11.001-foss-2020a | Albaicín |
| expat/2.2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| extrae/3.7.0 | Albaicín |
| FastTree/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| fftw/3.3.8 | Albaicín |
| FFTW/3.3.8-GCC-9.3.0-serial | Albaicín |
| FFTW/3.3.8-gompi-2020a | Albaicín |
| flex/2.6.4 | Albaicín |
| flex/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FLTK/1.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| fontconfig/2.13.92-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| foss/2020a | Albaicín |
| freeglut/3.2.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FreeSurfer/7.3.2 | Albaicín |
| freetype/2.10.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FriBidi/1.0.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| FSL/6.0.5.2 | Albaicín |
| g09 | Albaicín |
| gc/7.6.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GCC/9.3.0 | Albaicín |
| GCCcore/9.3.0 | Albaicín |
| gettext/0.20.1 | Albaicín |
| gettext/0.20.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Ghostscript/9.52-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| git/2.23.0-GCCcore-9.3.0-nodocs | Albaicín |
| GL2PS/1.4.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLib/2.64.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLM/0.9.9.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GLPK/4.65-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GMP/6.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| gnu9/9.3.0 | Albaicín |
| gnuplot/5.2.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GObject-Introspection/1.64.0-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| gompi/2020a | Albaicín |
| gperf/3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GraphicsMagick/1.3.36-foss-2020a | Albaicín |
| groff/1.22.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| GROMACS/gromacs-2023 | Albaicín |
| gsl/2.6 | Albaicín |
| GSL/2.6-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| Guile/1.8.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| gzip/1.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| h5py/2.10.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| HarfBuzz/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| hdf5/1.10.6 | Albaicín |
| HDF5/1.10.6-gompi-2020a | Albaicín |
| HDF5/1.12.0-gompi-2020a | Albaicín |
| help2man/1.47.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| HTSlib/1.10.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| HTSlib/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| humann/humann-3.6.1 | Albaicín |
| hwloc/2.1.0 | Albaicín |
| hwloc/2.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| hypre/2.18.1 | Albaicín |
| ICU/66.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ImageMagick/7.0.10-1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| imb/2019.6 | Albaicín |
| intltool/0.51.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| IQ-TREE/2.1.2-foss-2020a | Albaicín |
| JasPer/2.0.14-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Java/11.0.2 | Albaicín |
| Julia/1.8.2-linux-x86_64 | Albaicín |
| kallisto/0.46.2-foss-2020a | Albaicín |
| Kraken/1.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libcerf/1.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libdrm/2.4.100-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libevent/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libfabric/1.11.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libfabric/1.11.2 | Albaicín |
| libffcall/2.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libffi/3.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libFLAME/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
| libgd/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libGLU/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libglvnd/1.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libiconv/1.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libidn2/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Libint/2.6.0-gompi-2020a-lmax-6-cp2k | Albaicín |
| libjpeg-turbo/2.0.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libmatheval/1.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libpciaccess/0.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libpng/1.6.37-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libreadline/8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsigsegv/2.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsndfile/1.0.28-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libsodium/1.0.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LibTIFF/4.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libtool/2.4.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libunistring/0.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libunwind/1.3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libxc/4.3.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| libxml2/2.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| libxsmm/1.16.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| likwid/5.0.1 | Albaicín |
| LittleCMS/2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LLVM/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LMDB/0.9.24-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| LSD2/1.9.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Lua/5.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| lz4/1.9.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| M4/1.4.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| M4/1.4.19 | Albaicín |
| MAFFT/7.453-GCC-9.3.0-with-extensions | Albaicín |
| MAFFT/7.453-gompi-2020a-with-extensions | Albaicín |
| MAGMA/1.09b-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| make/4.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| makeinfo/6.7-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
| Mako/1.1.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| MATIO/1.5.19-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| matplotlib/3.2.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| maxima | Albaicín |
| MCL/14.137-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Mesa/20.0.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Meson/0.55.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| MetaPhlAn/3.0.9-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| metis/5.1.0 | Albaicín |
| METIS/5.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| mfem/4.2 | Albaicín |
| Miniconda3/4.9.2 | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ofi | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
| mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
| mumps/5.2.1 | Albaicín |
| MUSCLE/3.8.31-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
| mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
| NASM/2.14.02-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ncurses/6.1 | Albaicín |
| ncurses/6.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| netcdf-cxx/4.3.1 | Albaicín |
| netcdf-fortran/4.5.2 | Albaicín |
| netCDF-Fortran/4.5.2-gompi-2020a | Albaicín |
| netcdf/4.7.3 | Albaicín |
| netCDF/4.7.4-gompi-2020a | Albaicín |
| NetLogo/6.2.0-64 | Albaicín |
| nettle/3.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Ninja/1.10.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NLopt/2.6.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NSPR/4.25-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| NSS/3.51-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| numactl/2.0.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| nwchem-7.0.2 | Albaicín |
| Octave/6.2.0-foss-2020a | Albaicín |
| ohpc | Albaicín |
| omb/5.6.2 | Albaicín |
| omb/5.6.2 | Albaicín |
| openblas/0.3.7 | Albaicín |
| OpenBLAS/0.3.9-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
| opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
| OpenMPI/4.0.3-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| openmpi4/4.0.5 | Albaicín |
| OpenPGM/5.2.122-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| orca | Albaicín |
| os | Albaicín |
| Pango/1.44.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| papi/5.7.0 | Albaicín |
| parallel/20200522-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ParMETIS/4.0.3-gompi-2020a | Albaicín |
| PCRE/8.44-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| PCRE2/10.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pdtoolkit/3.25.1 | Albaicín |
| Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
| petsc/3.14.4 | Albaicín |
| petsc/3.14.4 | Albaicín |
| phdf5/1.10.6 | Albaicín |
| phdf5/1.10.6 | Albaicín |
| PhyloPhlAn/3.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| pixman/0.38.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pkg-config/0.29.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pkgconfig/1.5.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| plasma/2.8.0 | Albaicín |
| PLUMED/2.6.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| PMIx/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| pnetcdf/1.12.1 | Albaicín |
| PnetCDF/1.12.1-gompi-2020a | Albaicín |
| poetry/1.0.9-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| PRANK/170427-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| protobuf/3.13.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| prun/2.1 | Albaicín |
| ptscotch/6.0.6 | Albaicín |
| py3-mpi4py/3.0.3 | Albaicín |
| py3-numpy/1.19.0 | Albaicín |
| py3-scipy/1.5.1 | Albaicín |
| pybind11/2.4.3-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
| Pysam/0.16.0.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| Python/2.7.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Python/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| QIIME2/2021.8 | Albaicín |
| qrupdate/1.1.2-foss-2020a | Albaicín |
| R/3.6.3 | Albaicín |
| R/4.0.0-foss-2020a | Albaicín |
| re2c/1.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Roary/3.13.0-foss-2020a | Albaicín |
| SAMtools/1.10-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| SAMtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| scalapack/2.1.0 | Albaicín |
| ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2020a | Albaicín |
| ScaLAPACK/2.2-gompi-2020a-amd | Albaicín |
| scalasca/2.5 | Albaicín |
| SciPy-bundle/2020.03-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| scorep/6.0 | Albaicín |
| scotch/6.0.6 | Albaicín |
| SCOTCH/6.0.9-gompi-2020a | Albaicín |
| Seaborn/0.10.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| SEPP/4.3.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| siesta | Albaicín |
| Singular/4.3.0 | Albaicín |
| singularity/3.7.1 | Albaicín |
| sionlib/1.7.4 | Albaicín |
| sklearn-som/1.1.0-foss-2020a | Albaicín |
| slepc/3.14.2 | Albaicín |
| snappy/1.1.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| SQLite/3.31.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| STAR/2.7.7a-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| strainviz/StrainViz-1.1 | Albaicín |
| SuiteSparse/5.7.1-foss-2020a-METIS-5.1.0 | Albaicín |
| superlu_dist/6.1.1 | Albaicín |
| superlu/5.2.1 | Albaicín |
| SWIG/4.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Szip/2.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| tabixpp/1.1.0-GCC-9.3.0 | Albaicín |
| tau/2.29 | Albaicín |
| tbb/2020.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tcl/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| texinfo/6.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tk/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Tkinter/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| Trilinos/12.12.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
| trilinos/13.0.0 | Albaicín |
| trimAl/1.4.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| UCX/1.8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ucx/1.9.0 | Albaicín |
| UDUNITS/2.2.26-foss-2020a | Albaicín |
| UnZip/6.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| USEARCH/11.0.667-i86linux32 | Albaicín |
| util-linux/2.35-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| valgrind/3.16.1 | Albaicín |
| wget/1.20.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| X11/20200222-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| XML-LibXML/2.0205-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| xorg-macros/1.19.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| xprop/1.2.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| XZ/5.2.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| yaml-cpp/0.6.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| ZeroMQ/4.3.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| zlib/1.2.11 | Albaicín |
| zlib/1.2.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
| zstd/1.4.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |