Gestión de aplicaciones
Los usuarios de supercomputación disponen de una serie de aplicaciones científicas de diversas áreas ya instaladas y listas para usar. Asimismo, para aquellos usuarios que deseen construir y/u optimizar aplicaciones por sí mismos, se proporciona un conjunto de herramientas y bibliotecas de desarrollo (compiladores, bibliotecas matemáticas, bibliotecas de paso de mensajes, etc.).
Módulos disponibles
Para ver que módulos se encuentran disponibles puede usar el siguiente comando:
Herramientas de desarrollo
Estas son algunas de las herramientas con las que el usuario puede compilar, trazar y linkar sus aplicaciones. Los compiladores de Intel están optimizados para la arquitectura de las distintas plataformas que ofrecemos.
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Listado de aplicaciones
Las siguientes aplicaciones han sido instaladas y son mantenidas por el personal del Servicio de Supercomputación. Todas ellas constan de su correspondiente licencia de uso a nombre del Servicio de Supercomputación. Cualquier usuario que utilice estas aplicaciones se compromete a seguir las reglas de uso que aparecen en estas licencias.
Nota
En caso de que necesite otra aplicación no incluida en el listado inferior, puede sugerirnos su instalación, y estudiaremos si es viable.
Si usted desarrolla sus aplicaciones o pretende ejecutar diferentes aplicaciones de las abajo indicadas consulte cómo lanzar trabajos usando el sistema de colas.
Software | Arquitectura |
---|---|
adios/1.13.1 | Albaicín |
arpack-ng/3.7.0-foss-2020a | Albaicín |
Autoconf/2.69-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Automake/1.16.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
autotools | Albaicín |
Autotools/20180311-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
BamTools/2.5.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
bcbio-gff/0.6.6-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
BCFtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
BEDTools/2.29.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
binutils/2.34 | Albaicín |
binutils/2.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
biom-format/2.1.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
BioPerl/1.7.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Biopython/1.78-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
Bison/3.5.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Bison/3.8.2 | Albaicín |
BLAST+/2.10.1-gompi-2020a | Albaicín |
BLIS/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
Boost.Python/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
Boost/1.72.0-gompi-2020a | Albaicín |
boost/1.75.0 | Albaicín |
Bowtie2/2.4.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
bzip2/1.0.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
cairo/1.16.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
CD-HIT/4.8.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
charliecloud/0.15 | Albaicín |
CLISP/2.49-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
CMake/3.16.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
cmake/3.19.4 | Albaicín |
CMSeq/1.0.3-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
CP2K/7.1-foss-2020a | Albaicín |
cURL/7.69.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
cutadapt/2.10-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
DB_File/1.835-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
DB/18.1.32-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
DBus/1.13.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
DendroPy/4.4.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
DFTD4/dftd4-3.5 | Albaicín |
DIAMOND/2.0.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
dimemas/5.4.2 | Albaicín |
double-conversion/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Doxygen/1.8.17-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
EasyBuild/4.6.2 | Albaicín |
Eigen/3.3.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Eigen/3.4.0 | Albaicín |
ELPA/2020.11.001-foss-2020a | Albaicín |
expat/2.2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
extrae/3.7.0 | Albaicín |
FastTree/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
fftw/3.3.8 | Albaicín |
FFTW/3.3.8-GCC-9.3.0-serial | Albaicín |
FFTW/3.3.8-gompi-2020a | Albaicín |
flex/2.6.4 | Albaicín |
flex/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
FLTK/1.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
fontconfig/2.13.92-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
foss/2020a | Albaicín |
freeglut/3.2.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
FreeSurfer/7.3.2 | Albaicín |
freetype/2.10.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
FriBidi/1.0.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
FSL/6.0.5.2 | Albaicín |
g09 | Albaicín |
gc/7.6.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GCC/9.3.0 | Albaicín |
GCCcore/9.3.0 | Albaicín |
gettext/0.20.1 | Albaicín |
gettext/0.20.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Ghostscript/9.52-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
git/2.23.0-GCCcore-9.3.0-nodocs | Albaicín |
GL2PS/1.4.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GLib/2.64.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GLM/0.9.9.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GLPK/4.65-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GMP/6.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
gnu9/9.3.0 | Albaicín |
gnuplot/5.2.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GObject-Introspection/1.64.0-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
gompi/2020a | Albaicín |
gperf/3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GraphicsMagick/1.3.36-foss-2020a | Albaicín |
groff/1.22.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
GROMACS/gromacs-2023 | Albaicín |
gsl/2.6 | Albaicín |
GSL/2.6-GCC-9.3.0 | Albaicín |
Guile/1.8.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
gzip/1.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
h5py/2.10.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
HarfBuzz/2.6.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
hdf5/1.10.6 | Albaicín |
HDF5/1.10.6-gompi-2020a | Albaicín |
HDF5/1.12.0-gompi-2020a | Albaicín |
help2man/1.47.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
HTSlib/1.10.2-GCC-9.3.0 | Albaicín |
HTSlib/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
humann/humann-3.6.1 | Albaicín |
hwloc/2.1.0 | Albaicín |
hwloc/2.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
hypre/2.18.1 | Albaicín |
ICU/66.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
ImageMagick/7.0.10-1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
imb/2019.6 | Albaicín |
intltool/0.51.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
IQ-TREE/2.1.2-foss-2020a | Albaicín |
JasPer/2.0.14-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Java/11.0.2 | Albaicín |
Julia/1.8.2-linux-x86_64 | Albaicín |
kallisto/0.46.2-foss-2020a | Albaicín |
Kraken/1.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libcerf/1.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libdrm/2.4.100-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libevent/2.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libfabric/1.11.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libfabric/1.11.2 | Albaicín |
libffcall/2.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libffi/3.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libFLAME/2.2-GCCcore-9.3.0-amd | Albaicín |
libgd/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libGLU/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libglvnd/1.2.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libiconv/1.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libidn2/2.3.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Libint/2.6.0-gompi-2020a-lmax-6-cp2k | Albaicín |
libjpeg-turbo/2.0.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libmatheval/1.1.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libpciaccess/0.16-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libpng/1.6.37-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libreadline/8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libsigsegv/2.12-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libsndfile/1.0.28-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libsodium/1.0.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
LibTIFF/4.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libtool/2.4.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libunistring/0.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libunwind/1.3.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libxc/4.3.4-GCC-9.3.0 | Albaicín |
libxml2/2.9.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
libxsmm/1.16.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
likwid/5.0.1 | Albaicín |
LittleCMS/2.9-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
LLVM/9.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
LMDB/0.9.24-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
LSD2/1.9.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Lua/5.3.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
lz4/1.9.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
M4/1.4.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
M4/1.4.19 | Albaicín |
MAFFT/7.453-GCC-9.3.0-with-extensions | Albaicín |
MAFFT/7.453-gompi-2020a-with-extensions | Albaicín |
MAGMA/1.09b-GCC-9.3.0 | Albaicín |
make/4.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
makeinfo/6.7-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
Mako/1.1.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
MATIO/1.5.19-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
matplotlib/3.2.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
maxima | Albaicín |
MCL/14.137-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Mesa/20.0.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Meson/0.55.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
MetaPhlAn/3.0.9-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
metis/5.1.0 | Albaicín |
METIS/5.1.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
mfem/4.2 | Albaicín |
Miniconda3/4.9.2 | Albaicín |
mpich/3.3.2-ofi | Albaicín |
mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
mpich/3.3.2-ucx | Albaicín |
mumps/5.2.1 | Albaicín |
MUSCLE/3.8.31-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
mvapich2/2.3.4 | Albaicín |
NASM/2.14.02-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
ncurses/6.1 | Albaicín |
ncurses/6.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
netcdf-cxx/4.3.1 | Albaicín |
netcdf-fortran/4.5.2 | Albaicín |
netCDF-Fortran/4.5.2-gompi-2020a | Albaicín |
netcdf/4.7.3 | Albaicín |
netCDF/4.7.4-gompi-2020a | Albaicín |
NetLogo/6.2.0-64 | Albaicín |
nettle/3.6-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Ninja/1.10.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
NLopt/2.6.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
NSPR/4.25-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
NSS/3.51-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
numactl/2.0.13-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
nwchem-7.0.2 | Albaicín |
Octave/6.2.0-foss-2020a | Albaicín |
ohpc | Albaicín |
omb/5.6.2 | Albaicín |
omb/5.6.2 | Albaicín |
openblas/0.3.7 | Albaicín |
OpenBLAS/0.3.9-GCC-9.3.0 | Albaicín |
opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
opencoarrays/2.9.2 | Albaicín |
OpenMPI/4.0.3-GCC-9.3.0 | Albaicín |
openmpi4/4.0.5 | Albaicín |
OpenPGM/5.2.122-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
orca | Albaicín |
os | Albaicín |
Pango/1.44.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
papi/5.7.0 | Albaicín |
parallel/20200522-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
ParMETIS/4.0.3-gompi-2020a | Albaicín |
PCRE/8.44-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
PCRE2/10.34-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
pdtoolkit/3.25.1 | Albaicín |
Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Perl/5.30.2-GCCcore-9.3.0-minimal | Albaicín |
petsc/3.14.4 | Albaicín |
petsc/3.14.4 | Albaicín |
phdf5/1.10.6 | Albaicín |
phdf5/1.10.6 | Albaicín |
PhyloPhlAn/3.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
pixman/0.38.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
pkg-config/0.29.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
pkgconfig/1.5.1-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
plasma/2.8.0 | Albaicín |
PLUMED/2.6.0-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
PMIx/3.1.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
pnetcdf/1.12.1 | Albaicín |
PnetCDF/1.12.1-gompi-2020a | Albaicín |
poetry/1.0.9-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
PRANK/170427-GCC-9.3.0 | Albaicín |
protobuf/3.13.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
prun/2.1 | Albaicín |
ptscotch/6.0.6 | Albaicín |
py3-mpi4py/3.0.3 | Albaicín |
py3-numpy/1.19.0 | Albaicín |
py3-scipy/1.5.1 | Albaicín |
pybind11/2.4.3-GCCcore-9.3.0-Python-3.8.2 | Albaicín |
Pysam/0.16.0.1-GCC-9.3.0 | Albaicín |
Python/2.7.18-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Python/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
QIIME2/2021.8 | Albaicín |
qrupdate/1.1.2-foss-2020a | Albaicín |
R/3.6.3 | Albaicín |
R/4.0.0-foss-2020a | Albaicín |
re2c/1.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Roary/3.13.0-foss-2020a | Albaicín |
SAMtools/1.10-GCC-9.3.0 | Albaicín |
SAMtools/1.12-GCC-9.3.0 | Albaicín |
scalapack/2.1.0 | Albaicín |
ScaLAPACK/2.1.0-gompi-2020a | Albaicín |
ScaLAPACK/2.2-gompi-2020a-amd | Albaicín |
scalasca/2.5 | Albaicín |
SciPy-bundle/2020.03-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
scorep/6.0 | Albaicín |
scotch/6.0.6 | Albaicín |
SCOTCH/6.0.9-gompi-2020a | Albaicín |
Seaborn/0.10.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
SEPP/4.3.10-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
siesta | Albaicín |
Singular/4.3.0 | Albaicín |
singularity/3.7.1 | Albaicín |
sionlib/1.7.4 | Albaicín |
sklearn-som/1.1.0-foss-2020a | Albaicín |
slepc/3.14.2 | Albaicín |
snappy/1.1.8-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
SQLite/3.31.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
STAR/2.7.7a-GCC-9.3.0 | Albaicín |
strainviz/StrainViz-1.1 | Albaicín |
SuiteSparse/5.7.1-foss-2020a-METIS-5.1.0 | Albaicín |
superlu_dist/6.1.1 | Albaicín |
superlu/5.2.1 | Albaicín |
SWIG/4.0.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Szip/2.1.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
tabixpp/1.1.0-GCC-9.3.0 | Albaicín |
tau/2.29 | Albaicín |
tbb/2020.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Tcl/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
texinfo/6.7-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Tk/8.6.10-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Tkinter/3.8.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
Trilinos/12.12.1-foss-2020a-Python-3.8.2 | Albaicín |
trilinos/13.0.0 | Albaicín |
trimAl/1.4.1-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
UCX/1.8.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
ucx/1.9.0 | Albaicín |
UDUNITS/2.2.26-foss-2020a | Albaicín |
UnZip/6.0-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
USEARCH/11.0.667-i86linux32 | Albaicín |
util-linux/2.35-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
valgrind/3.16.1 | Albaicín |
wget/1.20.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
X11/20200222-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
XML-LibXML/2.0205-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
xorg-macros/1.19.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
xprop/1.2.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
XZ/5.2.5-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
yaml-cpp/0.6.3-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
ZeroMQ/4.3.2-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
zlib/1.2.11 | Albaicín |
zlib/1.2.11-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |
zstd/1.4.4-GCCcore-9.3.0 | Albaicín |